一、合同签订前的审计
在合同签订前需要对合同立项及乙方的资信和履约能力进行审计。
在立项方面，主要审查合同项目的必要性，有无更好的替代方案。要审查合同的立项手续是否完备，是否有法定代表人的委托书或其他具有法律效力的书面文件作为依据，是否经过职能部门和领导的签批。
在资信和履约能力方面。主要审查签约方是否具有合法经营资格：对承包方（分承包方）和采取招标和竞标的签约对象的主体资格进行审查。看其是否在工商部门登记并领取有效的营业执照；是否具有一定的组织机构和财产；签约方名称与营业执照上名称是否相符，并留存签约方的营业执照和法人代表给签约人的授权委托书复印件。对代理人代理签约的，还要审查代理人是否有代理权（授权委托书），其代理范围、合同标的限度、合同金额限度等是否与本次所签合同一致，代理期限、限定代理的总时间或限定代理权终止时间是否在本次签约的时间范围内。
在审查签约方资信能力时，要重点审查对方的规模、注册资本金、企业历史信誉、所产产品及已建项目的知名度等。
审查签约方是否有自主经营的权利，要防止工程转包和“皮包”公司参与。
二、合同条款及内容审计
条款审计包括合法性、严密性、准确性和完整性审查，是防止合同纠纷、杜绝违法、无效合同、提高合同履约率的重要措施。审查合同标的名称是否明确具体（采用通用标准名称或标准代号来表示），标的内容是否合法。
审查合同条款：签订的各类合同是否做到条款齐全、责任明确、逻辑性强、内容具体、用词准确、字迹清楚并按照示范文本要求填写。
当事人的名称和住所：应是经过资质审核的法人或组织名称、地点。
标的：必须是符合国家法律、法规的标的。
数量：在合同中必须明确标的数量，计量单位和计量方法，有些重要项目的数量必须用大写，防止涂改刮擦。
质量：质量条款必须符合国家有关规定和标准化要求。明确规定对标的及附件质量负责的条件、期限和验收标准。并明确标的物的质保内容及期限。
价款或酬金：包括单价和总价。审查单价、总价是否相符，合同价款是否合理。
结算：结算方式是否具体可行，开户银行、账户名称、账号、结算单位是否具体明白。
除法律另有规定外，必须用人民币计算和支付，并通过银行转账结算。
支付方法：合同中应明确支付条款，除法律另有规定外；定金（不超过合同标的额的百分之二十）要作为履行合同主要的担保方式。如特殊情况需支付预付款的合同，要作出详细的付款时间。
履约期限、地点和方式：要确定明确的履约期限，履约地点和履约方式。
违约责任：合同有法定违约责任的，按规定予以明确，否则要具体写明约定的违约金额或计算方法。
三、具体合同审计
1、购销合同审查：产品质量、数量和包装质量是否符合规定；数量的计量是否按国家规定或供需双方商定的方法；质量要求是否执行国家强制性标准、行业强制性标准或双方协商的标准；产品的规格、型号、色泽、等级、技术标准、工艺要求等内容是否齐全。
2、建筑工程承包合同及重大建设工程项目承包合同审查：是否按国家规定的程序和批准投资计划签订。
3、建筑、安装工程合同审查：是否明确工程范围、建设日期、中间交工工程开竣工时间、工程质量、工程造价、技术资料交付时间、材料和设备供应责任、拨款和结算、交工验收、双方互相协作等条款。
4、仓储保管合同审查：是否明确规定储存货物品名、规格、数量和保管方法；是否签订验收方法、入库、出库手续及损耗标准、损耗处理、费用负担和结算方法等。
5、财产租赁合同审查：是否明确规定租赁财产的名称、数量、用途、租赁期限、租金和租金交纳期限、租赁期间维修保养等责任；租金是否按国家统一规定的标准或当事人双方协商标准签订。
6、财产保险合同审查：是否明确规定保险标的、坐落地点、保险金额、保险责任、赔偿办法、保险费缴付办法以及保险起止期限等条款。
7、借款合同审查：是否明确了贷款的数额、用途、期限、利率、结算方法和违约责任等条款。
8、对外投资（联营）合同审查：是否明确投资总额、合同签订双方的出资额、出资比例、投资利润分配比例、投资收回期限及违约责任条款。
9、加工承揽同审查：加工、承揽的内容及保密相关条款是否符合规定和要求。
合同虽已签订，但发现显失公平、重大误解和签约方有欺诈行为，并严重损害我方利益的应及时与签约方协商变更或解除合同，并立即采取合法有效的措施，制止危害行为的发生，
必要时可以请求仲裁机构或人民法院予以变更或撤销。
四、合同履行审计
1、合同履行过程中对合同的履约质量进行审查，审查是否有违约行为，并提出处理意见。
2、发生合同纠纷时，审计部门要会同合同签订部门进行调查，核对事实，提出处理意见和措施。纠纷的处理，首先双方进行协商，协商不成时，及时向合同管理机关申请调解、仲裁，或直接向人民法院起诉。
3、合同出现变更、修改、终止或解除等情况，要审查合同变更是否符合规定解除的条件，是否依照法律规定的合同变更、解除的程序进行。当合同发生转让时，审查是否履行了合同规定的转让手续。
4、遇到合同条款不明时的审计
质量要求不明确时，审查是否按国家质量标准执行；无国家标准的，是否按通常标准执行。
期限要求不明确时，审查债权人（或债务人）是否随时向对方要求履行义务，是否给对方必要的准备时间。
履行地点不明确时，审查给付货币的，是否在给付的一方所在地履行，其他标的是否在发生义务的一方所在地履行。
价款约定不明确时，审查是否按国家规定的价格执行；没有国家规定价格的是否参照市场价格或同类物品的价格或劳动报酬的标准履行。
审查合同的履行是否贯彻了实际履行原则和适当履行原则。审查合同当事人是否按合同约定的标的履行，有无任意改变合同内容或标的，是否按合同规定的主体、客体、期限、地点和方法履行。
五、合同履行结果审计
1、核实违约责任和对损害企业利益的违纪行为的赔偿是否到位。
2、审查合同经济责任是否落实到有关部门、人员，责任是否明确。
3、审查合同实现经济效益情况，是否同签订合同前的预测相符并进行对比分析。对经济效益不理想或造成损失的合同要查明原因并提出相关处理建议。
4、对各类合同审查是否建立合同档案，有无违约行为和合同纠纷的处理记录。
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