夫妻申请的经济适用房的,离婚时,该房子能由夫妻协议分割,也能向法院起诉,请求分割。属于夫妻共同财产的,按照离婚房产分割的原则进行分割。且应当对未取得经济适用房的另一方予以经济补偿。属于夫妻个人财产的,则离婚时经济适用房归个人所有。夫妻有协议的,按照协议的约定。
【法律依据】
《中华人民共和民法典》第一千零八十七条离婚时,夫妻的共同财产由双方协议处理;协议不成的,由人民法院根据财产的具体情况,按照照顾子女、女方和无过错方权益的原则判决。对夫或者妻在家庭土地承包经营中享有的权益等,应当依法予以保护。